肠道微生物研究最重要的就在于样品的采集。对正常人来说，除了收集粪便之外，肠道部位的取样几乎不现实。而体外消化模拟器是模拟人体或动物体外模拟消化系统。是体外肠道模型包括批量培养模型、连续发酵培养系统（升结肠、横结肠和降结肠）、人类肠道微生态模拟器（胃、小肠、升结肠、横结肠、降结肠）试验的理想工具。

　　可应用于肠道微生态内细菌功能和多样性的研究、体外模拟肠道抗生素对肠道菌群变化的药效研究、微生态制剂和益生素生产研究；

　　可以对肠道环境以及人工瘤胃环境的真实模拟和参数的优化筛选，以及肠道动力学过程中，各参数的在线监测及控制，可用于体外环境中模拟肠道菌种生长的物理化学和生物参数。精准监测及控制该参数，可以获得复杂的肠道菌落在人体或动物肠道内新陈代谢的情况。

　　体外模拟胃肠道包含多组平行生物反应器，每一组都是相互独立运行操作，互不影响，所有参数都可以独立设置。主要用于：所选微生物的益生菌作用，所选食物的益生元效应，药物、微量元素，营养物等对肠道内微生物生长的影响。

　　体外模拟胃肠道主要用于模拟食物及药物的储存、混合、消化与排空。体外电动压缩器械对体外仿生人胃硅胶模型产生上下垂直的挤压；流加—排空装置朝向胃消化系统输送胃液，朝向十二指肠消化系统输送胆汁和胰液，并控制其分泌速率和食糜的排空速率，可用于多种不同类型和结构的食物及药物在真实人胃内的混合、消化和排空过程的有效模拟。