体外模拟消化系统具有降低成本和时间，提高实验重复性和准确性，可人工监控、定点取样等优点，能够部分或*替代活体实验，因而没有伦理限制，也避免了活体实验中较大的个体差异性。

　　体外消化系统可广泛应用于食品营养学，功能性活性物质代谢研究，药物释放动力研究，益生菌及益生元，食品毒理学研究，动物营养及饲料研究等。

　　人体胃肠道消化功能、能量代谢、疾病发生、免疫调节、营养物质消化吸收等均与肠道菌群息息相关。肠道菌群与机体间的相关作用及和对胃肠道消化吸收的影响，及对营养物质在人体胃肠道的代谢影响是目前的研究热点，应用体外消化系统进行研究是一种有效的技术方法。通过人体粪便提取物可以构建人工肠道菌群。完整的体外消化系统应该包含稳定的、有生物活性的肠道菌群。体外仿真器官，人工消化液，人工肠道菌群等共同组成了完整的体外消化系统。体外消化系统在研究肠道微生态系统变化情况，营养物质或功能性组分在人体中的代谢变化等，是未来的热点研究方向。